Клэр Уайли, VMD, DACVIM (внутренняя медицина мелких животных)
Исполнительный директор программы AKC DNA
С момента одомашнивания собак заводчики стремились каждое поколение выводить лучших собак, отвечающих их потребностям. В современную эпоху эта цель включает в себя разведение собак со структурой и темпераментом, близкими к стандарту породы, а также с улучшенным здоровьем и производительностью для выполнения конкретных задач. Многие из этих суждений основаны на проницательном наблюдении и четком ведении учета для отслеживания линий и родословных с течением времени. Селекционеры стали сами себе учеными, делая обоснованные предположения о том, какие линии подойдут их потребностям. Некоторые догадки сбываются прекрасно, тогда как другие терпят неудачу. С развитием технологий наши инструменты для прогнозирования важных признаков совершенствуются астрономически быстро, и заводчикам может быть трудно отслеживать научные данные и изменения. Целью этой статьи является предоставление базового обзора доступных генетических тестов с кратким описанием их преимуществ и ограничений. В настоящее время существует несколько фундаментальных применений ДНК собак: профилирование ДНК, тестирование болезней и признаков на основе ДНК, тестирование предков на основе ДНК и создание банков ДНК.
Собачий геном
Геном собаки был впервые картирован в 2005 году и основан на одной собаке, боксере по имени Таша.1 Владельцам собак и заводчикам важно понимать, что наши знания о геноме, содержащемся в 78 хромосомах и тысячах генов, постоянно развиваются. По мере совершенствования технологий существует множество версий генома, но все еще остаются области, которые плохо изучены. В рамках проекта «10 тысяч геномов собак», который находится в стадии реализации, тысячи собак секвенируются, чтобы углубить наше понимание собачьей генетики.
Отбор проб ДНК
Для получения образца ДНК собаки можно использовать множество различных методов, и каждый вариант имеет различия по качеству и значимости. Образец крови часто используется в качестве золотого стандарта высококачественной ДНК, но его сбор требует участия ветеринара. Больные лейкоциты также могут приобретать мутации в течение жизни собаки, известные как соматические мутации. ДНК, собранная из мазков со щек, используется регулярно, и владельцам ее легко собрать. Однако эта ДНК может быть загрязнена ДНК бактерий или даже других собак, когда они кормят или облизывают других животных. Качество, как правило, ниже и более изменчиво, чем у ДНК из крови. Для сбора ДНК можно использовать и другие образцы, например мочу, биопсию или ткани, собранные во время вскрытия.
Профилирование ДНК – происхождение
Основное использование профилирования ДНК собак – это подтверждение происхождения. Панели по определению происхождения опираются на наборы стандартизированных маркеров, используемых для установления уникальной личности собаки. Маркеры различаются в зависимости от панели и не являются взаимозаменяемыми. В рамках программы определения происхождения AKC профилировано более миллиона собак, чтобы предоставить надежные результаты определения происхождения. Эта услуга важна для проверки записей заводчиков, и ее значимость возрастает по мере расширения масштабов тестирования ДНК. Результаты генетических тестов на здоровье можно связать с результатами о происхождении, чтобы обеспечить точность результатов тестов.
ДНК-тестирование заболеваний и признаков
Тесты на заболевания и признаки включают сбор ДНК и скрининг генетических вариантов, связанных с конкретным заболеванием или признаком. Многие из этих тестов были разработаны на основе тесного сотрудничества организаций родительских клубов и ученых. Некоторые из этих тестов легко интерпретировать, используя понятные определения пораженных и здоровых собак. Другие, однако, имеют «неполную пенетрантность», поэтому наличие связанного с заболеванием варианта не всегда приводит к заболеванию. Что касается этих заболеваний, понимание распространенности этого пораженного варианта в популяции может помочь заводчикам уменьшить количество собак с этим признаком в будущем. Устранение всех пораженных собак в породе не всегда рекомендуется, поскольку это может привести к потере генетического разнообразия. Другие черты, полезные для породы, могут быть потеряны, поскольку выводятся вредные черты. Тщательное разведение требует обучения этому признаку, особенно в контексте конкретной породы из надежного ресурса. AKC расширяет наши усилия, чтобы помочь заводчикам использовать эти инструменты для принятия обоснованных решений.
Тестирование на происхождение на основе ДНК
Некоторые коммерческие компании предлагают тестирование происхождения на основе ДНК на основе библиотеки образцов для определения породного или географического происхождения. Эти тесты часто используются владельцами смешанных пород, которым интересно, какие чистокровные представители предков их собак. Как и другие тесты на происхождение человека, библиотека образцов, используемая для определения происхождения, основана на данных, сообщаемых владельцами, которые могут быть ошибочными. Эти тесты следует использовать для любопытства относительно происхождения собаки неизвестного происхождения, а не как тест на чистоту чистокровных собак.
ДНК-банкинг
Наконец, ДНК можно и нужно хранить для будущих испытаний по мере совершенствования технологий. Однако банковское дело бесполезно без тщательного учета признаков, которые интересуют заводчиков, таких как структура и здоровье. В сочетании с образцом спермы банковское дело также может стать ценным ресурсом для сохранения породы. АКС создает Банк сохранения чистокровных, который не только хранит ДНК, но и сохраняет сперму для поддержания генетического разнообразия в будущем. Кроме того, AKC собирает ДНК у собак-детекторов и отслеживает их показатели производительности, чтобы создать надежную базу данных, связывающую генетическую информацию и производительность. В будущем мы, возможно, сможем разработать генетические профили, которые предсказывают успех в работе.
В конечном счете, важно помнить, что эти генетические тесты являются частью сложной головоломки, из которой состоит вся собака. Это инструменты, помогающие заводчикам добиться того, в чем они преуспели на протяжении нескольких поколений. Как и у любого инструмента, надежность зависит от качества теста и понимания его ограничений. AKC — это надежный ресурс для заводчиков, где они могут найти заслуживающие доверия ответы. Для получения дополнительной информации о том, какие тесты рекомендуются для вашей конкретной породы, посетите сайт: www.akc.org/breeder-programs/breed-health-testing-requirements/.
- Линдблад-То, К., Уэйд, К., Миккельсен, Т. и другие.Последовательность генома, сравнительный анализ и структура гаплотипов домашней собаки. Природа 438, 803–819 (2005). https://doi.org/10.1038/nature04338
